ProductHighlights:
TheBovineLDBeadChipmicroarraykitenablesaccurategenotypingtounderstandtheimpactofgeneticsonmilkproduction,reproduction,health,andmore.Deliveringsuperior,scalablecontentataneconomicalprice,itallowsyoutoextendgenomicselectiontotheentireherd.Thisarrayoffers:
- Arobustimputationtooltoestimategenomicbreedingvalueaccurately
- Highcallrates,withdemonstratedimputationefficiencyof>98%
- Expertlyselectedcontentthatcanbeenhancedwithupto80,000customMarkers
- Containsall200SNPsontheISAGpanelforbovineparentage(100coreSNPsand100additionalSNPs)
- TheABIlitytointerrogateupto24samplesinparallel
Cost-EffectiveGenotypingofHerdAnimals
TheBovineLDv2.0BeadChip,togetherwiththeInfiniumBovineSNP50,InfiniumBovineHD,andiSelectCustomBeadChips,createsabroadgenotypingportfoliothatbreederscanrelyontocharacterizegeneticvariationandaccuratelyestimategenomicbreedingvalue.
WhiletheBovineHDandBovineSNP50BeadChipsprovidesuperiorpowertointerrogategeneticvariationinhigh-valueanimalsandsupportgenome-widestudies,theBovineLDv2.0BeadChipenablesthecost-effectivegenotypingoflower-valueanimals.
HighImputationAccuracy
TheBeadChip’sstrategicallyselectedSNPspossessdemonstratedreliability,highaverageminorallelefrequency(MAF),uniformdistributionacrossthebovinegenome,andexcellentimputationperformanceforarangeofglobaldairybreeds.The7,931SNPsontheBovineLDv2.0BeadChipweresubjectedtorigorousfunctionaltestingonmultiplebreedstoensurestrongperformance.IlluminaensuresthateveryBovineLDBeadChipoffers>99%averagecallrateacrosscommondairyandbeefcattlebreeds.
Superior,ScalableContent
IlluminadevelopedtheBovineLDv2.0BeadChipaspartofaBovineLDConsortiumincollaborationwithglobalbovineagriculturalthoughtleaders.IlluminascientistsandcollaboratorsreferencedhistoricaldatageneratedwiththeBovineSNP50BeadChiptoidentifythebestSNPcontentforimputationefficiencyamongglobaldairybreeds.1
InsilicotestingdeterminedthatthehighestimputationefficiencycouldbeachievedbyoptimizingMAFamongtargetedbreedsandevenlyspacingSNPsacrosstheentirebovinegenomewithhighermarkerdensitiesatthechromosomalends.Contentincludescoverageofallchromosomes,includingX,knownYhaplotypes,andmitochondrialDNA.
High-ThroughputFormat
TheInfiniumAssaypowersthismulti-samplegenotypingpanel,deliveringtheindustry’shighestcallratesandreproducibility.Theassay’sPCR-freesingle-tubesamplepreparationsignificantlyreduceslaborandpotentialsamplehandlingerrors.2,3Amulti-sampleformatfurtherreducesexperimentalvariabilityandoverallprojectcostbyallowingbreederstointerrogateupto24samplesinparallel.
LearnMoreAboutPlantandAnimalGenotyping
Specifications:
| InputQuantity | 200ngDNA(at50ng/ul) |
| NumberofMarkers | Fixedmarkers:7931evenlyspacedSNPsacrossthegenomeu003cbru003eCustommarkeradd-oncapacity:Upto80,000(with+kitversions) |
| Technology | Microarray |
| SpeciesCategory | Bovine |
| AutomationCapability | LiquidHandlingRobots,Autoloader2.xArrayLoader |
| SystemCompatibility | iScan |
illumina 激光共聚焦微珠芯片平台为全世界的科研用户提供了最为先进的SNP（单核苷酸多态性）研究平台。Illumina的SNP芯片有两类，一类是基于infinium技术的全基因组SNP检测芯片（Infinium™ Whole Genome Genotyping），适用于全基因组SNP分型研究及基因拷贝数变化研究，一张芯片检测几十万标签SNP位点，提供大规模疾病基因扫描(Hap660,1M)。另一类是基于GoldenGate™特定SNP位点检测芯片，根据研究需要挑选SNP位点制作成芯片(48-1536位点),是复杂疾病基因定位的最佳工具。
技术特点：
1． 独特的位点选择和设计，采用全世界公认的HAPMAP数据库中已经公布的TagSNP设计，具有无可比拟的全覆盖优势。
2． 高重复性和特异性
3． 超高通量的密度
4． 超高的成功率和准确性
人类SNP检测芯片
（1）Illumina Human 1M-duo beadchip：1张芯片上包含100万个探针信息，可在一张芯片上平行进行两个样品的检测。
（2）Illumina Humanomni1-quad beadchip：该款芯片是千人基因组计划可采用的第一个商业产品。1张芯片上包含100万个探针信息，可在一张芯片上平行进行四个样品的检测。该款芯片覆盖了已知领域的拷贝数变异（CNV）和已知疾病相关的SNPs，每个样本可以检测一百多万个位点（TagSNP）
（3）Illumina Human 660w-quad beadchip：1张芯片上包含66万个位点信息，可在一张芯片上平行进行四个样品的检测。并可以检测基因拷贝数（CNV）的变化。
（4）肿瘤相关SNP芯片（Cancer SNP Panel）：
l 1421个有效位点，
l 覆盖400个癌症相关基因
l 位点选自national cancer institute’s cancer genome anatomy project SNP500 cancer
Database。
（5）主要组织相容性研究SNP芯片（Major Histocompatibility Complex（MHC）Panel Set
l MHC 区域2360个SNP 位点，平均距离2kb。
（6）HumanCytoSNP-12 v1.0 DNA Analysis BeadChip Kit (12) 人CytoSNP 研究芯片 该款芯片的每张chip上可以同时检测12个样本，每个样本可以检测30万个位点（TagSNP）
其他SNP检测芯片
牛全基因组SNP芯片（Illumina BovineSNP50 Genotyping Beadchip）
犬全基因组SNP芯片（Illumina CanineSNP20 Genotyping Beadchip）
马全基因组SNP芯片（Illumina EquineSNP50 Genotyping Beadchip）
猪全基因组SNP芯片（Illumina PorcineSNP60 Genotyping Beadchip）
羊全基因组SNP芯片（Illumina OvineSNP50 Genotyping Beadchip）
玉米全基因组SNP芯片（Illumina MaizeSNP50 Genotyping Beadchip）
个性化定制芯片（GoldenGate™）
以GoldenGate技术为基础的用户自定义芯片，针对所有物种， 客户提供位点周围的序列信息或Rs号等即可，每个样品可同时进行96,384,768,1536plex SNP位点的研究。
芯片形式灵活：
Illumina公司的芯片有两种格式，即Sentrix Array Matrix和Sentrix BeadChip
Sentrix Array Matrix为大通量样本设计，每张芯片可进行96个样品的研究
Sentrix BeadChip每张芯片可进行16个样品的研究
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